с места будет дергаться из-за водителя,а не из-за электроники.а когда глохнешь(на предельно низких,нештатных оборотах) сбиваются настройки датчиков коленвала и распредвала,которые устанавливаются заново при каждом включении зажигания и заводке двигателя.и если зажигание не выключать,а просто опять завести,двигатель может работать неровно из-за неправильной работы датчиков.так же может заглючить на оборотах за отсечкой.
про двигатель и коробку:как я уже говорил,я не гадаю,что живучей.был конкретный пример,когда чел перепутал 4-ую и 2-ую переключаясь с 5-ой(м6 1,8)